Я бы поспешных выводов не делал, думаю что все в порядке с машиной.
У меня Хайлюкс 5 лет, до этого 5 лет дизельный Форд, и каждый год, с похолоданием, даже была своего рода настороженность: что то как то громко работать стал, что за шум? Но как придет жара, тихо, правда другие опасения, куда тяга пропала? Как будто лошадей 15 из 145 отпуск взяли)))) Если чек не горит, самое главное не было никаких перепрошивок и удалений сажевого, расход фактический совпадает с БК и в пределах нормы, то я бы не волновался.
На нулевом ТО прокатиться на тестдрайвовой, посмотреть там так или нет.
Ну и еще важно, само собой, топливо хорошего качества?